故事講述自東京大地震的十年后，人們逐漸淡忘這場大災難所帶來的恐怖回憶，而當時親身經歷了這場災難的五十嵐丸太，卻因為當時的意外而失去了記憶。現在的丸太與其他同學一樣過著普通而又平凡無奇的每一天，但這一切后來都被打破了。有一天，一名“紅色男子”突然現身學校，并將在場所有丸太的同班同學殺害了，雖然只有丸太得以幸存，但這也徹底改變了他的命運。本應被拯救了的丸太，卻被冠上莫須有的罪名并處以“死刑”，被強制送進了完全民營化的監獄“DEADMAN WONDERLAND（亡靈幻境）”。亡靈幻境是以東京復興為目的，在日本建立了唯一的完全民營化刑務所，表面上是為了囚犯而建立，并讓人觀光的樂園，但其實是所利用死囚互相廝殺，藉此吸引大量金錢投資，并把擁有特殊能力的死囚來做實驗的不人道之地。在這充滿絕望的“樂園”里，丸太和神秘少女?白再次相遇……